2016年，由于开始侵蚀世界的怪人“BugStar”=未知的电脑游戏病毒侵蚀开始。为了救助感染者，决定与BugStar战斗的天才玩家宝生永梦变身为假面骑士Ex-Aid。

在人们还没有察觉到的时候，未知的病毒——漏洞体，已经在社会上蔓延开来。政府在圣都大学附属医院秘密设立了电脑急救中心（CR），以应对病毒蔓延的情况，避免人类走向灭亡。 在数字游戏的世界中，打败游戏病毒漏洞体！使用与游戏企业共同研发出的玩家驱动器与卡带，候选人医生就能变身为假面骑士！ 年轻的实习医生宝生永梦背负的命运，就是变身为假面骑士艾克赛德，保护患者不受漏洞体侵害。

在人们还没有察觉到的时候，未知的病毒——漏洞体，已经在社会上蔓延开来。政府在圣都大学附属医院秘密设立了电脑急救中心（CR），以应对病毒蔓延的情况，避免人类走向灭亡。 在数字游戏的世界中，打败游戏病毒漏洞体！使用与游戏企业共同研发出的玩家驱动器与卡带，候选人医生就能变身为假面骑士！ 年轻的实习医生宝生永梦背负的命运，就是变身为假面骑士艾克赛德，保护患者不受漏洞体侵害。

游戏公司“玛奇导航”的社长约翰尼·玛奇岛，使用假面骑士风魔和忍者玩家们，撒下了新的臭虫病毒马基纳吉”的干部南云影成选择了游戏玩家，是一个因为难治之症余生不久的少女小圆。感染了新型病毒的人们都陷入了昏迷状态，在假想现实的世界里，度过了与现实不同的时间。在镜飞彩、花家大我、甚至是臭虫星Popy都被感染的情况下，小圆在假想现实的世界里，精神饱满地奔跑着马基纳吉”的目的所见的结果，在那里表现出来了。永梦在得到黎斗和帕拉多的协助下，为了在现实世界恢复患者们的意识，跳进了虚拟现实的世界。在那里也有贵利矢的身影玛奇导航”选择小圆作为玩家的理由和真正的目的是什么。不久，艾格泽德等人出现在假面骑士面前，是最强的最后的敌人。到底永梦能不能让年轻的医生们通过终极游戏改变患者的命运呢？

我们都忘记了、檀黎斗是诸恶之根源这件事—。在剧场版「假面骑士EX-AID True Ending」（与「假面骑士平成世代FINAL」）的故事之后，过去了2年——恶之根源·檀黎斗逃狱后，出现了的新的威胁…已经走上了各自的路途的骑士们，再次穿戴上了玩家驱动腰带！

ゲームと医療で人々を救う平成仮面ライダーシリーズ「仮面ライダーエグゼイド」のVシネマ版3部作の第3弾。劇場版「仮面ライダーエグゼイド　トゥルー・エンディング」から2年後の世界を舞台に、悪の根源・檀黎斗が放つ新たな脅威に立ち向かうライダーたちの活躍を描く。新ガシャット「ゴッドマキシマムマイティX」を手にした檀黎斗が仕かける最後のゲーム「ゾンビクロニクル」により、世界中が大パニックに陥ってしまう。強大なパワーを得た黎斗を止めるカギの存在に気付いた貴利矢は、正宗から託された言葉を胸に、たった1人でゲンムに立ち向かう。

身份不明的游戏病毒生命体来袭，人类将陷入前所未闻的危机。以恐怖的趋势扩大感染中，天空寺尊（假面骑士灵骑）也因为感染上这种病毒，失去了变身的能力。另一方面宝生永梦（假面骑士艾克赛德）追查敌人的真面目及感染源，但那正左右他自身的命运的“重大的真实”有着连系关系。被堵住去路的艾克赛德与灵骑。 谁能在这穷途末路的危机下拯救这两名假面骑士及人类们，那么，只有那些男人们。

故事从创骑夺走了艾克赛德的力量后说起。 曾与葛城巧公事的科学家最上魁星为了完成自己的研究，不惜启动了名为恩尼格玛的机器，欲将创骑与艾克赛德所处的两个平行世界合并。两个世界冲突相撞仅仅剩下24小时。在这关键时刻，玩家驱动器却因世界合并而无法使用。面对前所未有的危机，传说骑士们纷纷采取了行动。 桐生战兔顺利地捕捉到了最上的行踪，顺藤摸瓜地找到了创骑世界中的恩尼格玛。宝生永梦也在火野映司、如月弦太郎、天空寺尊等人的帮助下抵达了艾克赛德世界中的恩尼格玛。为了阻止两个世界的毁灭，众人需要恢复艾克赛德的力量，为此战兔竟决定主动开启恩尼格玛，连接两个世界。 即使最上与魁星如愿实现了合体，却仍不敌战兔与永梦为他精心设计的“秘技”。在两人与众位传说骑士的努力下，成功挫败了最上魁星的计划。世界合并的危机就此被解决，而假面骑士创骑的故事，还仍未结束。

故事发生在被天空之壁分为三区块的创骑的世界，竟然出现了艾克赛德世界的敌人——崩源体：为何不该出现在这的敌人会来到这世界？ 面对神秘敌人而毫无应对方法的战兔，一个身体半边被金属覆盖的神秘男人出现在他眼前。自称科学家的男人启动了巨大的机器，上空出现了倒立的另一个世界。

故事发生在被天空之壁分为三区块的假面骑士Build的世界，这里竟然出现了假面骑士Ex-Aid世界的敌人崩源体。面对神秘敌人而毫无应对方法的桐生战兔，他一筹莫展之时一个身体半边被金属覆盖的神秘男人在他眼前登场。 面对前所未有的危机，能拯救人类的只有那群假面骑士。凌驾前作的规模，前所未见的动作场面，不该有交集的英雄们终于相遇。谜团重重的故事即将解开……