“在沉没的世界里，我找到了你。”
近未来，不明原因的海平面上升，导致大片地表被海水淹没。
少年角岛夏男，年少时因事故失去一条腿，厌倦了城市生活，搬到了海边的乡村小镇。
他没有亲人，只有祖母曾经属于海洋地质学家的船和潜艇，以及债务。
为了找回“失去的未来”，夏男潜入海中，寻找据说祖母遗产沉睡的水下仓库。
他在那里发现的是沉睡在棺材状装置中的神秘少女阿托里。
她是一个精致而富有情感的机器人，几乎与人类没有区别。
从海底打捞出来的阿托里说道。
“我想完成主人留下的最后命令。在那之前，我会成为夏男的脚！”
在渐渐沉入海底的和平小镇，少年与机器人少女难忘的夏天开始了——
