美国深海探测潜艇“塞伦1号”在例行任务中坠毁,当局命令潜艇设计师(主角)组织一支由士兵和各类科学家组成的队伍,登上另一艘同类型的潜艇“塞伦2号”“出海救援塞伦1号”,成员中有两名女性,其中一名是潜艇设计师的前妻。
搜寻的线索是塞伦1号上的一个“黑匣子”。据此,救援队潜入一个非常隐蔽的海沟。途中,黄色潜艇被一个巨大的白色不明物体包裹。船长用电击驱赶了怪物。三名潜水员出海调查,发现这里的海藻发生了变异,而且数量惊人。一名潜水员被藏在海藻林中的外星生物袭击身亡。另外两名幸存者收集了一些变异的海藻,回到了潜艇上。
为了躲避变异生物的袭击,潜艇进入海沟探索,原来海沟底部有一个巨大洞口,潜艇浮出水面,艇员们穿着类似宇航服的特制防护服,进入深邃的洞穴,发现里面竟然有人工挖掘的痕迹,里面满是变异生物,有的形似巨蜂,有的形似海蛇和恐龙……